Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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