Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ush1cQ9ES64 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms