Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms