Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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