Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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