Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms