Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q9D8L0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9D8L0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms