Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn9Q9D805 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms