Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MsraQ9D6Y7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MsraQ9D6Y7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms