Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PrameQ9D4Z5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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