Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms