Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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