Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp11Q9CZJ1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms