Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc77Q9CZH8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms