Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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