Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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