Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms