Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pfdn1Q9CWM4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn1Q9CWM4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn1Q9CWM4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn1Q9CWM4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn1Q9CWM4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn1Q9CWM4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn1Q9CWM4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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