Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms