Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd5Q9CQP3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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