Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt23Q99PS0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms