Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a6dQ99N07 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a6dQ99N07 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ms4a6dQ99N07 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms