Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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