Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6cQ91ZQ1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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