Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms