Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms