Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms