Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms