Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms