Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rab11fip5Q8R361 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab11fip5Q8R361 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab11fip5Q8R361 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab11fip5Q8R361 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab11fip5Q8R361 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab11fip5Q8R361 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rab11fip5Q8R361 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11fip5Q8R361 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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