Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms