Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I8

Defb19, Beta-defensin 19, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb19Q8K3I8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Defb19Q8K3I8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Defb19Q8K3I8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb19Q8K3I8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb19Q8K3I8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Defb19Q8K3I8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Defb19Q8K3I8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Defb19Q8K3I8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Defb19Q8K3I8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb19Q8K3I8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Defb19Q8K3I8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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