Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms