Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc5a11Q8K0E3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms