Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rasgef1bQ8JZL7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rasgef1bQ8JZL7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rasgef1bQ8JZL7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms