Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf628Q8CJ78 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms