Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClasrpQ8CFC7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClasrpQ8CFC7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms