Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms