Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms