Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef8Q8CE24 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef8Q8CE24 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef8Q8CE24 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef8Q8CE24 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef8Q8CE24 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef8Q8CE24 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef8Q8CE24 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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