Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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