Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms