Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hdac7Q8C2B3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdac7Q8C2B3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac7Q8C2B3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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