Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms