Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8BP99 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Q8BP99 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BP99 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms