Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc2Q8BKV1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms