Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms