Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbfox3Q8BIF2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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