Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms