Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim65Q8BFW4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms